潔淨廠房建築設計具有很強的綜合性。建築設計是為生產與生活籌畫室內、外空間的工作，藉以尋求空間功能合理、造型美觀、經濟耐用的綜合效果。潔淨廠房建築設計則著重為了淨化而去解決各項潔淨技術專業分類在應用工程中的統籌安排。以獲得最優化綜合效果的空間，特別是潔淨室的建築設計與空氣淨化設計，兩者在空間佈局與氣流組織、建築氣密與微正壓控制等方面有著密切的關係，做好上述設計工作能保證潔淨室內密性和潔淨度的要求。
1、一般規定
1)潔淨廠房的建築平面和空間佈局，應具有適當的靈活性。
2)潔淨區的主體結構不宜採用內牆承重。
3)潔淨室的高度以淨高控制，淨高應以100mm為基本模數。
4)潔淨廠房主體結構的耐久性與室內裝備和裝修水準相協調，並應具有防火、控制溫度變形和不均勻沉陷的性能(地震區應符合抗震設計規定。
5)廠房變形縫應避免穿過潔淨區。
6)送、回風管和其他管線需暗敷時，應設置技術夾層、技術夾道或地溝等。
7)穿越極層的豎向管線需暗敷時，宜設置技術豎井。
8)對兼有一般生產和潔淨生產的綜合性廠房，其方案設計和構造的處理，應避免在人流與物流運輸以及防火方面對潔淨生產帶來不利影響。
2、人員淨化和物料淨化設施
1)潔淨廠房內應設置人員淨化、物料淨化用室和設施，並應根據需要設置生活用室和其他用室。
2)人員淨化用室，宜包括雨具存放間、管理室、換鞋室、存外衣室、盥洗室、潔淨工作服室和空氣吹淋室等。
3)廁所、淋浴室、休息室等生活用室，以及工作服清洗間和乾燥間等其他用室，可根據需要設置。
4)人員淨化用室和生活用室，應符合下列要求：
①人員淨化用室的入口處，應設淨鞋器。
②存外衣室和潔淨工作服室應分別設置。
③外衣存衣櫃和潔淨工作服櫃應按編制人數每人設一櫃。
④盥洗室應設洗手和烘乾設備。
⑤水龍頭應按最大班人數每10人設置一個。
⑥潔淨區不得設廁所。
⑦人員淨化用室內的廁所應設前室。
⑧空氣吸淋室應設在潔淨區人員入口處，並應與潔淨工作服室相鄰。
⑨單人空氣吹淋室按最大班人數每30人設一台。
⑩當僅為100級垂直層流潔淨室時，可改設氣閘室。
⑩潔淨區工作人員超過5人時，空氣吹淋室一側應設旁通門。
5)人流路線應避免往復交叉。
6)根據不同的空氣潔淨度等級和工作人員數量，潔淨廠房內人員淨化用室和生活用室的建築面積應合理確定。一般可按潔淨區設計人數平均每人4。6rri2計算。
7)潔淨工作服室內，對空氣淨化應有一定的要求。
8)潔淨室的設備和物料出入口，應根據設備和物料的性質、形狀等特徵設置物料淨化用室及其他設施。
9)物料淨化用室的佈置，應防止淨化後物料在傳遞過程中被污染。