活性污泥有多種培養方法，但不同的方法所要求的培養時間和人力物力均不同。應根據廢水水質、氣候、實際許可的條件等情況來選擇培養方法。
1.培養前的準備工作
（1）各構築物建成，並經清池清除建築垃圾，靜壓試驗證明無滲漏，無下沉位移，最後按有關規程驗收合格。
（2）電器、機械、管路等全部設備建成並經單機試車、聯動試車正常。最後按有關規程（說明書）驗收合格。
（3）根據日後運行管理需要，有條件的汙水處理廠（站）需進行最基本的常規化驗測試，如pH、水溫、COD、DO、生物相等，用以指導活性污泥的培養過程和日常運行。
（4）基礎資料的調查摸底，包括污水流量晝夜變化情況，水質（pH、水溫、COD、BOD5/CODCr、含氮、含磷、有毒物質等）及其變化情況，各種設施和設備的技術參數。有條件的地方最好對受納水體(如接納排汙的河流等)本底水質調查備案，以便考察若干年後對受納水體的影響提供依據。
（5）根據處理水質狀況備足必需的營養物(碳源、氮源、磷源)，以備缺什麼補什麼。採用接種培菌法還需備足污水性質相似其他汙水處理廠（站）的幹（或濃縮）污泥作為活性污泥微生物培養用的菌種。
（6）操作人員應熟悉整個系統的管道佈置和公用工程方面的情況，瞭解污泥培養的基本過程和控制要求。
（7）人員到位，自培養和馴化後一般應使系統連續運行，不能脫人。
（8）編制必要的化驗和運轉的原始記錄報表以及初步的建章立制。從培菌伊始，逐步建立較規範的組織和管理模式，確保啟動與正式運行的有序進行。
2．自然培菌
自然培菌，也稱直接培菌法。它是利用廢水中原有的少量微生物，逐步繁殖的培養過程。城市污水和一些營養成份較全、毒性小的工業廢水，如食品廠、肉類加工廠廢水，可以考慮這種培養方法，但培養時間相對較長。自然培菌又可分為間歇培菌和連續培菌二種。
（1） 間歇培菌。將曝氣池注滿廢水，進行悶曝（即只曝氣而不進廢水），數天后停止曝氣，靜置沉澱1 h ，然後排出池內約1/5的上層廢水，並注入相同量的新鮮污水。如此反復進行悶曝、靜沉和進水三個過程，但每次的進水量要比上次有所增加，而悶曝時間要比上次縮短。在春秋季節，約二、三周就可初步培養出污泥。當曝氣池混合液污泥濃度達到1克/升左右時，就可連續進水和曝氣。由於培養初期污泥濃度較低，沉澱池內積累的污泥也較少，回流量也要少一些，此後隨著污泥量的增多，回流污泥量也要相應增加。當污泥濃度達到工藝所需的濃度後，即可開始正常運行，按工藝要求進行控制。
（2） 連續培菌。先將曝氣池進滿廢水，然後停止進水，悶曝半天至一天后可連續進水。連續曝氣，進水量從小到大逐漸增加，連續運行一段時間（與間歇法差不多），就會有活性污泥出現並逐漸增多。曝氣池污泥量達到工藝所需的濃度時，按工藝要求進行控制。
由於自然培菌法是用廢水直接培養活性污泥，其培菌過程也是微生物逐步適應廢水性質並獲得馴化的過程。
3．接種培菌
接種培菌法的培養時間較短，是常用的活性污泥培菌方法，適用於大部分工業廢水處理廠。城市污水廠如附近有種泥，也可採用此法，以縮短培養時間。接種培養法常用的有如下二種：
(1) 濃縮污泥接種培菌。採用附近汙水處理廠的濃縮污泥作菌種(種泥或種污泥)來培養。城市污水和營養齊全、毒性低的工業廢水處理系統的活性污泥培養，可直接在所要處理的廢水中加入種泥進行曝氣，直至污泥轉棕黃色時就可連續進污水（進水量應逐漸增加），此時沉澱池也投入運行，讓污泥在系統內迴圈。為了加快培養進程，可在培養過程中投加未發酵過的大糞水或其它營養物。活性污泥濃度達到工藝要求值即完成了培菌過程。從經濟上講，種泥的量應盡可能少，一般情況下控制在稀釋後使混合液污泥濃度在0.5g/L以上。
對有毒工業廢水進行培菌時，可先向曝氣池引入河水，也可用自來水（需先曝氣一段時間以脫去其中的餘氯），然後投入種污泥和未經發酵的大糞水進行曝氣，直至污泥呈棕黃色後停止曝氣，讓污泥沉降並排掉一部分上清液，再次補充一定量的大糞水繼續曝氣，待污泥量明顯增加後，逐步提高廢水流量。在培菌的後期，污泥中微生物已能較好地適應工業廢水水質。
（2）幹污泥接種培菌。“幹污泥”通常是指經過脫水機脫水後的泥餅，其含水率約為70～80%。本法適用於邊遠地區和取種污泥運輸距離較遠的情況。
幹污泥接種培菌的過程與濃縮污泥培菌法基本相同。接種污泥要先用剛脫水不久的新鮮泥餅，投加至曝氣池前需加少量水並搗成泥漿。幹污泥的投加量一般為池容積的2～5%。
幹污泥中可能含有一定濃度的化學藥劑(用於污泥調理)，如藥劑含量過高、毒性較大，則不宜用作為培菌的種泥。鑒定污泥能否作接種用，可將少量泥塊搗碎後放入小容器(如燒杯或塑膠桶)內加水曝氣，經過一段時間後如果泥色能轉黃，就可用於接種。
污泥培菌的注意事項：
（1）活性污泥培菌過程中，應經常測定進水的pH、COD、氨氮和曝氣池溶解氧、污泥沉降性能等指標。活性污泥初步形成後，就要進行生物相觀察，根據觀察結果對污泥培養狀態進行評估，並動態調控培菌過程。
（2）活性污泥的培菌應盡可能在溫度適宜的季節進行。因為溫度適宜，微生物生長快，培菌時間短。如只能在冬季培菌，則應該採用接種培菌法，所需的種污泥要比春秋季多。
（3）培菌過程中，特別是污泥初步形成以後，要注意防止污泥過度自身氧化，特別是在夏季。有不少廠都發生過此類情況。這不僅增加了培菌時間和費用，甚至會導致汙水處理系統無法按期投入運行。要避免污泥自身氧化，控制曝氣量和曝氣時間是關鍵，要經常測定池內的溶解氧含量，要及時進水以滿足微生物對營養的需求。若進水濃度太低，則要投加大糞等以補充營養，條件不具備時可採用間歇曝氣。
（4）活性污泥培菌後期，適當排出一些老化污泥有利於微生物進一步生長繁殖。
（5）工業廢水處理廠在生產裝置投產前往往沒有廢水進入，而一旦生產裝置投產後，排放的廢水就需及時處理。此時，應根據實際情況合理確定培菌時間，並提前準備種污泥及養料等。
（6）如曝氣池中污泥已培養成熟，但仍沒有廢水進入時，應停止曝氣使污泥處於休眠狀態，或間歇曝氣(延長曝氣間隔時間、減少曝氣量)，以盡可能降低污泥自身氧化的速度。有條件時，應投加大糞、無毒性的有機下腳料(如食堂泔腳)等營養物。
（7）大部分的廢水處理廠都有二個(格)以上的曝氣池。這種情況下可先利用一隻曝氣池培養活性污泥，然後再輸送到相鄰其它曝氣池進行多級擴大培養。本法適用於規模較大的廢水處理。
