建立萬級淨化車間對於食品安全生產的菌污染防護措施就起到相當重要的作用
食品細菌污染防護是食品安全體系中的一個環節，其重點在於生產加工過程中，如何有效避免細菌對食非蓄意的污染，並將這種非蓄意污染預測出來，建立相應的細菌污染防護措施。以此保證食品不被細菌二次污染或二次交叉感染，保證食品品質的安全衛生，有效的延長食品的保質期，降低食品在質保期內黴變的概率。
1、人的帶菌對食品安全的危害，含但不限於：如人體手部細菌、身體新陳代謝物、移動時揚塵等；
2、車間硬體環境的安全，含但不限於：窗戶、牆面、天花、地面、通風口等消毒清潔；
3、生產配套設備及輔料的安全，含但不限於：設備表面、周轉箱、容器器具、工作臺面、推車等；
4、常見的不確定因素，含但不限於：人消毒、空氣消毒、設備消毒、蠅蟲污染、包材消毒、地面消毒等。
一、保證健康上崗：
1、從業人員100%體檢，每年至少重複一次健康檢查，保證不患有礙於是品衛生的疾病，並需隨時進行自我醫學觀察，及時發現並報告自己患有的可能污染食品的疾病。從一定意識上講，這比每年一次的健康檢查更重要。
二、培養衛生意識：
1、提高從業人員對食品衛生重要性的認識。
2、對不衛生行為不加注意者需當即重罰，以免相互間傳遞錯誤形成隱患。
3、強化企業老總食品衛生意識的表率作用，自行杜絕麻痹思想和僥倖心理，做到警鐘長鳴。
三、學習和掌握食品衛生知識，有效的專業知識培訓，提高食品從業人員的衛生知識。使其自覺改正以往不正確操作，對於不同崗位技能方面應有所側重。
四、按規定的規程進行管理：
1、食品從業人員良好衛生素質和個人衛生習慣的體現是按規定的規程和方法進行崗位操作。
2、將污染防護計畫每個細節分解成執行表格，實行數位化及看板化管理。
食品防護計畫可以幫助企業將細菌污染降到最小化的步驟，並有助於企業為員工創造一個安全的工作環境，為顧客提供有品質保證的產品，使得企業打造食品安全零缺陷的同時，也保障了企業的盈利。