無塵淨化工程中，材料的選用非常重要，合理的選擇會起到很好的作用，再次闡述有關選擇無塵淨化工程裝修材料的要求：
1 .無塵淨化車間在室內裝修設計中，在使用木材和石膏板時應加注意。
2 .根據《無塵淨化施工及驗收規範》規定，在使用木材和石膏板時應加注意。
3 .（1）無塵淨化工程使用的木材的含水率不應大於16%，並且不得外露使用。由於無塵淨化氣次數大，並且一定要做好防腐防潮處理。（2）一般無塵淨化工程需用石膏板時必須用防水石膏板，而對於生物無塵淨化工程由於經常用水擦洗和用消毒液沖洗，即使防水石膏板也要受潮變形，不耐沖洗，所以規定生物無塵淨化工程不應採用石膏板作罩面材料。
4 .不同無塵淨化工程在選擇室內裝修材料時還需考慮不同的個性需求。
5 .無塵淨化工程通常都需頻繁擦拭，除了用水擦拭還會用消毒水、酒精、其他溶劑等擦拭，這些液體通常都有一定的化學品性，會使一些材料表面變色、脫落，這就要在裝修材料上面有一定的耐化學品性；無塵淨化工程如手術室為了殺菌的需要，通常會安裝三氧O3發生器，O3（即臭氧）是一種強氧化氣體，會加速環境中物體特別是金屬的氧化銹蝕，也會使一般塗層表面由於氧化而褪色，變色，所以此類無塵淨化工程要求其裝修材料有很好的耐氧化性，不會產生銹蝕。
6 .目前國內知名淨化工程公司施工中，對於無塵淨化工程牆面裝修材料主要有以下幾種：
a 瓷磚：經久性陶瓷磚鋪貼後，長時間不會裂、不變形、不吸汙。可以用下面簡單方法判斷：用墨水滴在產品背後，看墨水是否自動散開。一般來說，墨水散開速度越慢，吸水率越小，內在品質越優，產品經久性越好，反之越差。
b 防菌牆塑；防菌牆塑在少數潔淨房中曾經採用過，主要用於輔助用房和潔淨通道等精華等級較低的部位，防菌牆塑主要採用牆面粘貼方式，接縫採用密拼方式，類似於貼牆紙，因其採用粘貼式，壽命不長，受潮易變形起鼓，且其裝修檔次整體較低，應用範圍狹窄。
C 裝飾面板，是將實木板精密刨切成厚度為0.2㎜左右的微薄木皮，以夾板為基材，經過膠粘工藝製作成的具有簡單裝飾作用的裝飾板材，無塵淨化是夾板存在的特殊方式，厚度為3㎝。