手術室淨化工程是通過空氣淨化系統及空調系統，控制手術室內的污染物、細菌與溫濕度，以此來降低手術中產生的切口感染，提高成功率。那麼淨化工程中北京淨化手術室是如何做到除菌的呢?
淨化手術室離子過濾能力強，對進入手術室的空氣通過初、中、高效篩檢程式以控制室內塵埃含量，具有除去99.97%直徑0.5微米以上粒子的能力。此外，空氣呈流線流入室內，以等速通過房間後流出，室內產生的塵埃或微生物不會向四周擴散，隨氣流方面經回風口排出室外，可使室內空氣具有一定的生物潔淨度。
手術室淨化又分為垂直層流和水準層流。垂直層流將高效篩檢程式安裝在房頂上，整個房頂是過濾層，氣流垂直向下，回風口設在靠地面的平面上。水準層流將篩檢程式安裝在手術病人腳端一側牆面上，水準吹送氣流，回風口設在相對一側近牆面的房頂上。水平空氣流時，手術者身體滴氣流的阻擋，影響了手術區潔淨度;垂直空氣流時，切口在手術者頭部的上風向，也增加了細菌污染的機會，而且投資高。
淨化手術室淨化並不等於滅菌，只是通過篩檢程式除菌、除塵，必須配合地面、牆面、物體表面的清潔、消毒。並注意及時清理空氣過濾裝置，才能保值手術中空氣潔淨，滿足各種手術的需要。此外，還要建立科學的人流、物流流程及嚴格的分區管理，最終最終達到控制微粒污染的效果。