選擇步進電機應遵循先選電機後選步進電機驅動器原則，先明確負載特性，再通過比較不同型號步進電機的靜力矩和矩頻曲線，找到與負載特性最匹配的步進電機。
1、一般應選用力矩比實際需要大百分之五十到百分之百的步進電機，因為步進電機不能過負載運行，即便是瞬間超載都可能造成失步、停轉或不規則原地來回作動。
2、上位控制器輸入的脈衝電流必須夠大(一般要》10mA)，以確保光電耦合器穩定導通，否則會導致步進電機失步;如果輸入脈衝頻率過高，會因個別脈衝接收不到，導致步進電機失步。
3、啟動頻率不應太高，應在啟動程式中設置加速過程，即從規定的啟動頻率開始，加速到設定頻率，否則就可能不穩定，甚至處於惰態。
4、電機如果未固定好，造成強烈共振，也會導致步進電機失步。
5、應瞭解步進電機的固有弱點：輸入脈衝頻率過高，易導致丟步;輸入脈衝頻率過低，易出現共振;轉速偏高時扭矩降低明顯。
6、應瞭解最新型步進電機的性能，必要時選用採用了最新控制技術的高級步進電機系統，高級系統既可以使步進電機在高速狀態下減少共振，還能運用減少步進電機反電動勢的技術，增加電機在高速狀態下的扭矩。