設計是淨化車間建設的第一步，也是非常關鍵的一步，淨化車間設計水準直接關係到之後的施工，影響淨化車間的穩定性、可靠性、經濟性。
淨化車間設計
1. 合理佈置工藝流程和建築平面
流程盡可能短，減少交叉往復，人流、物流走向合理。要配備人員淨化室、物料淨化室，除配備產品工序要求的用室外，還應配備潔具室、洗衣間、暫存室等，每間用室相互獨立，淨化車間的面積應在保證基本要求前提下，與生產規模相適應。
2. 選擇滿足淨化車間特點的建築構造和材料
淨化車間設計時，淨化車間牆、頂板材一般多採用50mm厚的夾芯彩鋼板，其特點為美觀、剛性強。圓弧牆角、門、窗框等一般採用專用氧化鋁型材。地面可採用環氧自流坪地坪或高級耐磨塑膠地板，有防靜電要求的，要選用防靜電型。送回風管道一般用鍍鋅鋼板，不宜選用玻璃棉類材料保溫。照明應選用淨化車間專用燈具。
3. 劃分和佈置空調淨化和排風系統，選擇合理的空氣淨化通風設備
設計淨化系統組織的原則是相鄰二級篩檢程式的效率不能太接近，也不能相差太大。一般採用初效、中效、亞高效(或高效)三級篩檢程式。也可分四級，增加一級高效篩檢程式。排風系統有一般排風系統、有機氣體排風系統、酸性氣體排風系統、鹼性氣體排風系統等，淨化車間設計時，要根據實際情況選擇。
4. 淨化車間設計時，無論是新建還是重新改造的淨化車間，都一定依照國家相關標準、規範進行。
淨化技術的興起不過是上個世紀的事情，但今天淨化技術發揮著重要作用則是有目共睹的。隨著產品向著高、精、尖方向發展，對淨化車間的依賴度也越來越高。而隨著淨化技術的發展，建設淨化車間的技術含量也越來越高，非專業人士不能也。除了在生產領域，淨化技術還會逐漸應用於家庭、公共場合，為人們提供更潔淨的生活空間。