山東醫科大學的前世今生——
1864年--齊魯大學；
1952年--山東醫學院；
1984年--山東醫科大學；
2000年--山東大學。
1863年，美國人狄考文搭乘一艘900噸輪船，航行166天到達上海，後轉途煙臺，於1864年正月到達登州（今蓬萊）。1863年秋，他和先到達的一對傳教士夫婦，在登州城西北一座破觀音廟辦了一個住宿的“蒙塾”，招了6個“寒素不能讀書”的兒童。
8年後，取“以文會友”的意思，學堂定名為“文會館”。後來，登州文會館成為齊魯大學的前身。按照這個說法，齊魯大學比1901年成立的山東大學堂（山東大學前身）要早的多。
當年山東醫科大學現在成來了山東大學齊魯醫學部，首任部長由著名生殖專家、山東大學副校長陳子江教授兼任。
齊魯醫學部有著悠久的歷史和深厚的人文積澱，其歷史可追溯至1864年創辦于山東登州的文會館。1911年，共和醫道學堂大講堂在濟南正式落成，其後的齊魯大學醫學院是我國最早建立的醫學院校之一，成為今天山東大學醫科的歷史源頭。
1924年，原齊魯大學千名校友為慶祝建校60周年捐資修建了校友門。1952年由齊魯大學醫學院、山東省立醫學院、華東白求恩醫學院合併成立山東醫學院。1985年山東醫學院更名為山東醫科大學，大學設基礎醫學部、臨床醫學部、衛生系、藥學系、口腔系和護理系等專業，後各系改設為學院。護理學院的創辦始于1914年齊魯大學醫學院開設的四年制護士班，後該專業在戰爭和歷史的滄桑變遷中停辦，1984年經衛生部批准再次恢復護理系建制，成為全國首批恢復高等護理教育的院校之一；藥學院前身為始建於1920年的齊魯大學藥科，後幾經滄桑變遷，於1971年在山東泰安樓德重建藥學系，1974年2月遷回濟南，是我國最早成立的高等藥學專業院校之一；公共衛生學院的前身是始建於1952年的山東醫學院衛生系，之後在院系調整時調出，1977年經教育部和衛生部批准重建；口腔醫學院的前身為山東醫科大學口腔系，始建於1977年。
一個世紀以來，山東大學醫學學科彙聚了一大批享譽國內外的著名專家學者，如江清教授、侯寶璋教授、尤家駿教授、趙常林教授 、蘭錫純教授、孫鴻泉教授、宮乃泉教授、張匯泉教授、李纘文教授、蘇應寬教授 、周廷沖院士、黃翠芬院士、洪濤院士、張運院士、謝立信院士和于金明院士等，他們分別是我國醫學各有關學科的奠基人和開拓者之一。
2000年7月，原山東大學、山東醫科大學、山東工業大學合併組建為新的山東大學。
2012年5月，山東大學按照國際標準、世界一流的要求和有利於發揮綜合性大學舉辦醫學教育優勢的原則，以全面改革的精神，整合醫學院、公共衛生學院、口腔醫學院、藥學院、護理學院等5個學院以及山東大學齊魯醫院、山東大學附屬第二醫院、山東大學口腔醫院、山東大學附屬生殖醫院等4所附屬醫院，成立齊魯醫學部。
2015年9月，學校為落實教育部等六部門《關於醫教協同深化臨床醫學人才培養改革的意見》，依據《山東大學章程》及《山東大學綜合改革方案》，頒佈了《醫學教育管理體制改革實施方案》，重構齊魯醫學部管理架構，成立齊魯醫學部黨工委。齊魯醫學部下設辦公室（與黨工委辦公室合署辦公）、政工處、人事處、教務處、科研與國際交流處、研究生處、財務與資產管理處、繼續（網路）教育中心和醫院管理處等黨政管理機構。同時撤銷醫學院建制，組建基礎醫學院和臨床醫學院。